《宅男的福利研究所》延續了第一部的故事,在未來的洛杉磯,人類和機器人共存,但兩者的關係卻並不融洽。在第一部中,兩位主角率領著機車聯盟挺身而出,阻止了反派奪取控制機器人的程式。在《宅男的福利研究所》中,主角們又面臨著新的挑戰。
在這個故事中,反派是一個名為克利昂的人,他是一個極具野心的開發商,為了實現自己的開發計畫,他打算開發一款新的機器人,這款機器人不僅擁有高強的戰鬥力,而且還能獨立思考。克利昂的計畫遭到了一群名為「機車聯盟」的反抗組織的追捕,他們誓死守護人類的自由。
這部電影的故事發生在《宅男的福利研究所》事件兩年後。此時,洛杉磯已經成為一個充滿犯罪和暴力的城市。為了應對這一嚴峻形勢,警方成立了一個新的特別行動小組,由傑克和安妮領導。這個小組被賦予了特殊的權力,可以不經審判就逮捕任何人。小組成員還配備了先進的武器和裝備,以便他們能夠更好地打擊犯罪。